In de jaren negentig wordt volledig gestopt met het kippervervoer en specialiseert het bedrijf zich meer met transporten naar Scandinavië. Daarnaast houdt Boerema zich bezig met bulk- en containertransport. Eind jaren negentig gaat Boerema skelet woningen en beton elementen vervoeren. Dit is specialistisch werk vanwege te hoge en brede ladingen.